另外这次火山灰对欧洲航空交通造成的影响将是深远的。火山学专家表示，尽管火山喷发会在几天之后逐步减弱，但对空中交通的影响最长可达6个月，这对本来不景气的欧洲航空业来说打击将会很大。16号，汉莎航空公司、英国航空公司、法航—荷航公司等航空股开盘时大幅下跌。有分析说，本次火山灰给欧洲航空交通带来的混乱甚至超过了“9·11”恐怖袭击事件。当时，美国领空只不过才关闭了3天。此外，还有分析指出，本次火山灰可能促使相关国家修改航空安全条例，并有可能促使飞机制造企业研究应对火山灰的技术。

火山灰对航空的影响与平常的大雾天气还是不一样的，大雾天气通常造能见度降低从而影响飞行。但火山灰一般是飘浮到比较高的高空中，火山灰云团对能见度影响有限。实际上16号白天，欧洲大陆多个国家天气晴好，只是云层稍厚一些。关闭机场主要是从飞机飞行的安全角度考虑做出的决定。因为火山灰云团所在的高度正是喷气客机飞行的高度，大量烟尘颗粒会阻塞飞机气流阀门，并引起发动机故障。火山灰中含有玻璃颗粒和岩石粉末，粘附在飞机发动机叶片上后会导致引擎停转，粘附在机体表面后将损坏机身，从而造成重大航空事故。烟尘还可能威胁到所有飞机外部的传感器。在过去20年间，火山烟尘导致的飞机故障已有80多起。1982年印尼火山爆发的火山灰就曾经使英国航空公司的一架大型喷气式客机4台发动机停转，幸好机组人员设法使3台发动机恢复工作，并紧急降落，保住了机上263名乘客的性命。

由于冰岛火山爆发产生的火山灰干扰，德国航空交通管制中心(DFS)16号宣布，境内16家国际机场13家停飞，其中包括德国最大的机场法兰克福机场。DFS一位发言人透露，目前除了斯图加特、纽伦堡和慕尼黑的国际机场仍在使用外，其他13家机场，如柏林、汉堡、汉诺威、科隆、法兰克福等均被关闭，大批旅客滞留。目前，航空安全管理当局还不清楚机场关闭将持续多久，气象部门说他们将每6小时发布一次气象预报。此外，据德国媒体报道，机场关闭还影响到准备从美国回国的德国总理默克尔的预定行程，目前还不清楚她将改道到哪个机场降落。

受到这次火山灰的影响，波兰航空局发言人16号上午宣布，波兰已经封闭了除南方城市克拉科夫以外的波兰所有空域，什么时候恢复航行，将另行通知。这样，可能有多国首脑会取消参加波兰已故总统卡钦斯基葬礼的计划。波兰总统府发言人表示，如果火山灰云团不能尽快散去，波方将考虑推迟原定于18号举行的卡钦斯基夫妇的葬礼。