埃及政府一贯指责境外势力通过非法资助在埃及活动的非政府组织以煽动示威者，埃及司法部在声明中强调指出，现在，仅仅在首都开罗，就有大约300家非政府组织正在接受未经许可的国外资助。为此，埃及军方和政府多次警告国外势力不要“干预”埃及国内事务。由埃及国际合作部牵头，多部门从去年7月起开始对涉嫌国外非法资助的案件进行调查。

据当地媒体报道，自埃及前总统穆巴拉克下台以来，美国已经向埃及的非政府组织提供了4000多万美元的资助。埃及《金字塔报》评论说，这些资助主要用于支持埃及的所谓民主和自由进程，在埃及广泛传播西方的价值观、生活方式和意识形态。事实上，它们都是在美国国会的资金支持下监督海外选举和促进外国民主的工具。但西方媒体认为，埃及军方正在不断扩大和深化其影响，“打着反对外国干预的幌子燃起埃及民众心中的民族主义情绪，以转移国际视线，转化矛盾指向”。

阿拉伯媒体分析认为，埃及的举措可能会引发其与美国等国家之间的外交战，甚至会影响到美国此前已经承诺的对埃及本年度12亿美元的军事和经济援助等。